蓋付き家庭用浄化槽は、主に家庭排水の嫌気性消化に使用され、分子状有機物を低分子に分解し、固形有機物濃度を低減します。同時に、低分子および基質は、水素生成酢酸菌およびメタン生成菌によってバイオガス（主にCH4とCO2）に変換されます。バイオガススラリー中の窒素およびリン成分は、後の資源利用のための栄養分として残留します。長期滞留により嫌気性殺菌効果が得られます。
